版权跟商标的冲突

自己申请的商标跟别人的版权冲突了怎么处理？
最近有客户咨询自己的公司申请注册的商标，已经通过初审目前正在公告期，却被另一家公司以侵犯对方版权为由异议了，像这种情况怎么处理？
首先这种情况的话可以在异议通知书的规定期限内进行答辩，一般是收到异议通知书30日内进行答辩；
答辩资料包括：
1.加盖公章的公司营业执照副本复印件或签字的申请人身份证复印件；
2.商标异议答辩通知书及信封原件；
3.异议答辩书；
4.商标代理委托书； 
5.材料目录、证据目录；
6.证据材料（商标设计构思，知名度，销售及广告等相关的证据材料）
审查时间一般在12个月左右会出答辩结果。
联系我的时候请说是在搜即讯信息网上看到的，谢谢。